Podpeški kamnolom je razglašen za naravni spomenik, saj se v njem nahaja temno siv apnenec, ki vsebuje bele lupine fosilnih školjk. Kamnolom je edinstven tudi zaradi t.i. podpeškega marmorja, ki so ga kopali že Rimljani in ga po Ljubljanici prevažali v Emono. Ljubljanico so zaradi lažjega rečnega prometa na območju Podpeči tudi regulirali. Pristanišče v Podpeči je ohranilo večji pomen in delovalo do 19. stoletja, ko je bila zgrajena železniška proga, ki je prečila Ljubljansko barje. Podpeški marmor je pri svojem arhitekturnem delu rad uporabljal najslovitejši slovenski arhitekt Jože Plečnik, iz njega pa so zgrajene mnoge znamenite stavbe v Sloveniji in tujini. Številne hiše v naselju imajo iz kamna oblikovana vhodna vrata in vogale hiše.